中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蜜蜂所研究人員構(gòu)建出東方蜜蜂的泛基因組序列
2023年12月12日來源：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蜜蜂研究所
近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蜜蜂研究所聯(lián)合首都師范大學(xué)等單位，構(gòu)建了首個東方蜜蜂的泛基因組序列，并揭示了結(jié)構(gòu)變異在東方蜜蜂演化與環(huán)境適應(yīng)性方面的作用。相關(guān)研究成果發(fā)表在《分子生態(tài)資源（Molecular Ecology Resources）》上。
東方蜜蜂是一種具有重要生態(tài)與經(jīng)濟價值的傳粉昆蟲，對其遺傳變異進行解析有助于理解其種群動態(tài)、演化規(guī)律以及環(huán)境適應(yīng)能力。然而，迄今為止的研究局限于使用單一的參考基因組序列來研究小尺度的遺傳變異，忽略了大尺度的基因組變異。
本研究采用三代測序技術(shù)為東方蜜蜂的祖先群體創(chuàng)制了染色體水平的參考基因組序列，結(jié)合525個基因組重測序數(shù)據(jù)，構(gòu)建出東方蜜蜂的首個泛基因組序列。研究發(fā)現(xiàn)，超過30%的東方蜜蜂的基因在不同群體間存在變異，這些可變基因很可能為蜜蜂適應(yīng)不同的環(huán)境條件提供了豐富的基因庫。本研究進一步發(fā)現(xiàn)，大尺度的結(jié)構(gòu)變異是獨立于小尺度的點突變之外的遺傳變異類型。通過關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)，有44個結(jié)構(gòu)變異與環(huán)境因子高度連鎖，實驗表明其中一個結(jié)構(gòu)變異很可能通過降低臨近基因的表達來促進我國阿壩地區(qū)的東方蜜蜂適應(yīng)當(dāng)?shù)氐暮洵h(huán)境。本研究不僅豐富了東方蜜蜂的基因組學(xué)資源，而且為將來的種質(zhì)資源保護與遺傳改良提供有價值的基因信息。
該研究得到國家自然科學(xué)基金與中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)費的資助。
原文鏈接：https://doi.org/10.1111/1755-0998.13905
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